SMK Negeri 03 Mukomuko yang dahulunya bernama SMK Negeri 2 Mukomuko Utara didirikan pada tahun 2006 dan mulai beroperasi tahun 2007. Satu-satunya SMK yang mempunyai program keahlian Teknik Komputer Jaringan dan Tata Busana, Namun pada tahun 2009/2010 SMK Negeri 3 Mukomuko berkembang dengan menambah 2 jurusan baru yaitu Multimedia dan Restoran. Dan pada Tahun 2014 dibuka lagi jurusan Akuntansi, sampai saat ini ada 5 jurusan yang ada di SMK Negeri 3 Mukomuko ini.  SMK Negeri 3 Mukomuko berada di kecamatan XIV KOTO dan terletak disebelah Barat ibu kota Kabupaten Mukomuko, dengan posisi perbatasan antara Kecamatan kota Mukomuko dengan Kecamatan Lubuk Pinang dan didirikan atas dasar, keinginan masyarakat yang didukung oleh pemerintah setempat, Bapak Camat Kecamatan Mukomuko Utara mengusulkan agar di Kecamatan Mukomuko Utara dibangun SMK Negeri 3 Mukomuko atas swadaya masyarakat.

Pada saat didirikan Kepala Sekolah yang ditugaskan adalah Dra. Nurhasni, M.Pd  yang masa tugasnya Juli 2007 s/d Januari 2011, kemudian terjadi rotasi kepala sekolah sebelum mendapatkan kepala sekolah defenitif maka dinas pendidikan menunjuk plt salah seorang guru di SMK Negeri 3 Mukomuko atas nama Sutardi, M.Pd, SMK Negeri 3 Mukomuko mendapat kepala sekolah baru bernama KANAL, S.Pd, M.TPd yang mulai tugas 22 September 2011 s/d Oktober 2016. Terjadi mutasi kepala sekolah oleh dinas pendidikan kabupaten Mukomuko pada oktober 2016 yang menunjuk Sutardi, S.Pd, M.Pd sebagai kepala SMK Negeri 3 Mukomuko yang baru. Pada tanggal 1 Oktober 2016 seluruh SMA dan SMK seIndonesia diambil alih oleh provinsi. Dinas Pendidikan Provinsi Bengkulu menugaskan kembali pimpinan SMK Negeri 3 Mukomuko kepada KANAL, S.Pd, M.TPd sampai dengan 15 Oktober 2021, dikarenakan pensiun. Dan sekarang SMK Negeri 3 Mukomuko dipimpin oleh seorang Plt. Basri Efendi, M.TPd